УКП (учебно-консультационный пункт) Новосибирского института инженеров водного транспорта был открыт в Омске в 1956 г. Библиотека, предположительно, была открыта одновременно с УКП. Однако, с 1956 по 1961 гг. никаких сведений о существовании библиотеки нет. Первая заведующая - Герман Лидия Васильевна. Работала с 1961 г. Пер­вое помещение библиотеки располагалось в пароходстве. Это была одна комнатка в кото­рой находились и библиотека и методисты УКП. Весь фонд библиотеки занимал один шкаф. В основном методички. Лидия Васильевна начала собирать книги, которые присылал в основном Новосибирский институт инженеров вод­ного транспорта. По окончанию первого года существования, фонд библиотеки (судя по инвентар­ным книгам) насчитывал 898 экземпляров. В основном это была учебная литература. В 1962 г. УКП преобразован в Омский факультет инженеров водного транспорта.

    В 1977 г. институт и библиотека переехали в здание речного училища. На 1 января 1977 г. фонд 10 654 экз. (Библиотека имела самостоятельный фонд, не была слита с библиотекой училища). Вторая заведующая Беринт Галина (апрель 1980 г. -декабрь 1981 г.) Фонд на этот период составлял 12 163 экз. С 1980 г. библиотека располагалась в новом помещении на Красном пути. Третья заведующая (с декабря 1981 г.) Заславская Галина Ивановна. Галина Ивановна уделяла большое внимание формированию фонда. С декабря 1981 г. по декабрь 1982 г. фонд на­считывал 14 295 тыс. экз. (т.е. увеличился на 2 тысячи, что по тем временам составило до­вольно большую цифру). Денег на комплектование выделялось очень мало. Библиотеке помогали формировать фонд омские вузы: Политехнический институт, Автодорожный институт. Много литературы отдала библиотека речного училища. Пароходство и судоремонтный завод помогали деньгами в течении многих лет.

    В 1991 г. Омский факультет преобразован в Омский филиал Новосибирской академии водного транспорта. К этому моменту библиотека на­считывала около 32-х тысяч экземпляров. С 1992 г. библиотека переехала в здание на Маркса, 3 и в штат включили ещё одного человека. Каталог был алфавитный, начали вести примерно с 1970-х гг. С 2007 г. ОИВТ является обособленным структурным подразделением (филиалом) ФБОУ ВПО "Новосибирская государственная академия водного транспорта" и включает в себя два структурных подразделения: по программам среднего профессионального образования (ведутся педагогическим составом Омского командного речного училища имени капитана В.И. Евдокимова, присоединенного в 2007 году к ФБОУ ВПО "НГАВТ"; · по программам высшего профессионального образования (ведутся профессорско-преподавательским составом бывшего Омского филиала ФБОУ ВПО "НГАВТ", работающего в составе ФБОУ ВПО "НГАВТ" с 1956 года).

С 2007 г. библиотеки училища и института объединены в одну.